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Subrogation

Mis à jour le 19 octobre 2026 · Par l'équipe purpay

Définition. En paie, la subrogation permet à l'employeur de percevoir directement les indemnités journalières de la Sécurité sociale dues à son salarié en arrêt de travail, parce qu'il lui maintient son salaire pendant ce temps. Le salarié reçoit un seul versement, son salaire, et l'employeur se fait rembourser par la CPAM. Elle se demande dans le signalement d'arrêt de travail en DSN, avec ses dates de début et de fin.

Le mot vient du droit civil : être « subrogé », c’est prendre la place de quelqu’un pour exercer ses droits. En paie, l’employeur prend la place du salarié pour toucher ses indemnités journalières (IJSS) de l’Assurance maladie pendant un arrêt de travail.

Comment ça marche

Sans subrogation Avec subrogation
Qui reçoit les IJSS ? Le salarié, directement de la CPAM L’employeur
Ce que verse l’employeur Le salaire diminué de l’absence, plus son complément éventuel Le salaire maintenu, en tout ou partie
Pour le salarié Deux versements, à des dates différentes Un seul versement, à la date de paie habituelle
Pour l’employeur Pas d’avance de trésorerie Une avance, puis le remboursement par la CPAM

Le maintien de salaire peut être intégral ou partiel. Il peut venir de la loi, de votre convention collective ou de votre décision. Le complément légal (90 % puis 66,66 % du salaire brut à partir de 1 an d’ancienneté) est détaillé dans notre guide arrêt maladie et employeur.

Exemple

Un salarié au SMIC, en arrêt 10 jours, a droit à 7 jours d’IJSS après les 3 jours de carence, soit 7 × 30,69 € = 214,83 € selon le calcul de notre guide sur l’arrêt maladie. Sa convention prévoit un maintien intégral avec subrogation :

  • vous lui versez son salaire habituel à la fin du mois ;
  • la CPAM vous verse les 214,83 € d’IJSS ;
  • la différence reste à votre charge.

Pour estimer les montants, utilisez le simulateur d’IJSS et le calcul du maintien de salaire.

En DSN

La subrogation se déclare dans le signalement d’arrêt de travail, qui remplace l’attestation de salaire :

  1. cochez la case subrogation ;
  2. date de début : celle de l’arrêt de travail ;
  3. date de fin : la fin de subrogation prévue par la convention collective ou l’accord, sans la limiter à la durée de l’arrêt prescrit ;
  4. vérifiez l’IBAN du compte qui doit recevoir les indemnités : en cas d’erreur, les prestations déjà versées ne sont pas régularisées.

Si vous subrogez, vous pouvez envoyer les signalements d’arrêt au fil de l’eau ou avec la DSN mensuelle. En cas de reprise anticipée, signalez-la tout de suite : des IJSS versées à tort peuvent être récupérées auprès de votre entreprise. Vous suivez les paiements reçus dans le BPIJ (bordereau de paiement des indemnités journalières) du tableau de bord DSN.

Information générale, à jour à la date indiquée. Elle ne remplace pas un conseil adapté à votre situation : vérifiez votre convention collective et les textes officiels.

Questions fréquentes

La subrogation est-elle obligatoire pour l'employeur ?

Elle peut être prévue par votre convention collective, ou mise en place à votre initiative quand vous maintenez le salaire. Vérifiez d'abord ce que dit votre convention.

Comment demander la subrogation en DSN ?

Dans le signalement d'arrêt de travail : cochez la case subrogation, indiquez comme date de début celle de l'arrêt et comme date de fin la fin de subrogation prévue par la convention ou l'accord, et vérifiez l'IBAN du compte qui doit recevoir les indemnités.

Que se passe-t-il si le salarié reprend plus tôt ?

Faites un signalement de reprise anticipée dès que vous la connaissez. Sinon, des indemnités journalières peuvent être versées à tort, et en cas de subrogation l'Assurance maladie peut les récupérer auprès de votre entreprise.

Comment suivre les indemnités reçues ?

Avec le bordereau de paiement des indemnités journalières (BPIJ), consultable dans le tableau de bord DSN sur net-entreprises. Il détaille les règlements reçus pour les indemnités subrogées de vos salariés.

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